Мультсериал является продолжением оригинального сериала “Люди Икс” 1992 года. Сюжет начинается сразу после смерти профессора Икс, лидера команды мутантов. В новых эпизодах мутанты сталкиваются с новыми угрозами и должны научиться справляться без своего наставника..