Только раз в тысячу лет, когда в ночном небе появляется комета, пробуждается покемон Джирачи, способный удовлетворить любое желание. На этот раз Джирачи нашел несколько новых друзей: Эша, Пикачу, Макса и остальных участников компании. Они должны спасти его от злого волшебника, который хочет использовать невероятную энергию Джирачи, чтобы воскресить самого легендарного и могущественного покемона.